Koronaviruksen Omicron-variantti aiheuttaa tällä hetkellä paljon huolta ympäri maailmaa, ja tämä johtuu siitä, että ei tiedetä, missä määrin rokotteet ovat edelleen tehokkaita tai onko se tarttuvampi, mutta CNCAV vastaa joihinkin alla oleviin kysymyksiin hyvin tärkeä.
Miten Omicron syntyi? Onko se aggressiivisempi, tarttuvampi? Toimivatko rokotteet?
Miksi Omicron on luokiteltu huolenaiheeksi (VOC)?
SARS-CoV-2-viruksen Omicron-variantti on kerännyt suuren määrän mutaatioita emokantaan verrattuna.
Jotkut näistä mutaatioista ovat yhteisiä joillekin aikaisemmille varianteille ja voivat johtaa lisääntyneeseen tarttuvuuden ja tarttuvuuden lisääntymiseen, antiviraalisten vastemekanismien välttämiseen ja jopa osittaiseen resistenssiin infektion, rokotuksen jälkeen hankituille vasta-aineille tai resistenssiin joillekin monoklonaalisille vasta-ainehoidoille.
Muut mutaatiot ovat uusia tälle variantille tai niitä on havaittu vain laboratoriossa, joten niiden vaikutusta ei tunneta hyvin, mutta niitä havaitaan virusbiologiassa tärkeissä proteiineissa / proteiinien alueilla.
Kuinka kaikki nämä muutokset toimivat yhdessä, on tällä hetkellä vaikea sanoa. Lisätietoa on saatavilla lähiviikkoina.
Tietoja joistakin Omicron-variantin mutaatioista löytyy täältä.
Vertaileva luettelo mutaatioista, jotka on tunnistettu Omicron-variantista ja muista tähän mennessä huolestuneista tai kiinnostavista muunnelmista.
Miksi virus kerää mutaatioita?
Tartunnan aikana viruksen on tehtävä miljardeja ja miljardeja kopioita geneettisestä koodistaan. Joskus replikointiprosessissa tapahtuu virheitä ja jotkin "kirjaimet" "kopioivat" väärin. SARS-CoV-2:lla on mekanismeja useimpien kopiointivirheiden korjaamiseen, mutta nämäkään mekanismit eivät voi toimia täydellisesti ja jotkut mutaatiot pääsevät silti karkuun.
Useimmilla mutaatioilla on vähäinen tai olematon vaikutus viruksen biologiaan ja niillä on vain epidemiologinen merkitys (mutaatiosormenjälkien avulla voidaan seurata viruksen leviämistä populaatiossa).
Mutta jos nämä mutaatiot ilmaantuvat sattumalta, antavat virukselle etua (esim.: korkeampi tarttuvuus, kyky "ohittaa" osa kehon suojamekanismeista), ne valitaan ja leviävät edelleen.
Ne ovat klassisia evoluutioperiaatteita, kulloinkin ympäristöolosuhteisiin sopivimpien selviytymistä, mutta joita tapahtuu nyt huimaa vauhtia, koska tartuntatapaukset antavat virukselle useita mahdollisuuksia sopeutua.
Miten Omicron-variantti ilmestyi?
Yleensä mutaatiot kerääntyvät yksitellen, ja ne voidaan jäljittää useiden virussukupolvien aikana, kunnes vallitseva variantti ilmaantuu. Molekyyliepidemiologiassa työskentelevät tutkijat rakentavat fylogeneettisiä puita, joiden avulla he jäljittävät eri sekvensoitujen näytteiden virusten "sukusuhteen" asteen (samanlainen kuin sukupuut, joiden kautta ihmiset jäljittävät perhesiteensä).
Omicronista ja joistakin aiemmista virusvarianteista puuttuu useita sukupolvia sidoksia. Tärkeimmät teoriat tällä hetkellä:
– Näiden linkkisukupolvien viruskannat olisivat voineet kiertää pidempään alueilla, joilla ei ole riittävää sekvensointikapasiteettia niiden havaitsemiseen, kerryttäen mutaatioita.
– virus kehittyi isännässä, joka ei kyennyt poistamaan infektiota hyvin pitkään aikaan (kuukausiin), mikä riittää keräämään kaikki havaitut mutaatiot ennen kuin se siirtyy eteenpäin.
Miten Omicron liittyy muihin sekvensoituihin SARS-CoV-2-kantoihin Afrikan mantereelta.
Onko Omicron-variantti aggressiivisempi?
Tällä hetkellä on vaikea sanoa, aiheuttaako Omicron-variantti COVID-19:n lievempiä vai vakavampia muotoja raportoitujen tapausten pienen määrän ja sen havaitsemisesta kuluneen lyhyen ajan vuoksi. Infektiosta taudin vakavan muodon kehittymiseen kestää yleensä yli viikko, ja suurin osa tähän mennessä tunnistetuista tapauksista on nuorilla, joilla on pienempi riski COVID-19:n vakavasta kehittymisestä. Lisää tietoa on todennäköisesti saatavilla lähitulevaisuudessa, mutta kaikkiin toistaiseksi SARS-CoV-2-muunnelmiin on liitetty merkittävä vakavan taudin etenemisen riski. Tällä hetkellä varovainen lähestymistapa olisi olla ottamatta huomioon, että Omicron-variantin aiheuttama infektio kehittyisi eri tavalla.
Onko Omicrom-variantti paljon siirrettävämpi?
Jälleen on liian aikaista sanoa muiden tietojen puuttuessa. Omicron-variantista tuli hallitseva hyvin lyhyessä ajassa ensimmäisten sekvenssien dokumentoinnin jälkeen, mutta se teki niin hyvin pientä määrää muiden muunnelmien aiheuttamia infektioita vastaan sen löytämisen aikaan.
Meidän on katsottava, kuinka Omicron-infektiotapausten määrä kehittyy alueilla, joilla on lisääntynyt muiden virusmuunnelmien esiintyvyys (esim. Delta).
Suojaavatko nykyiset rokotteet edelleen Omicron-varianttia vastaan?
Ja tässä tarvitaan lisää tietoa. Vaikka jotkin kertyneistä mutaatioista yksitellen voivat heikentää sairauden tai rokotuksen kautta saadun immuunivasteen antamaa suojaa, tarvittaisiin suuri määrä mutaatioita suojamekanismien ohittamiseksi kokonaan.
Immuunivaste on polyklonaalinen. Pelkästään vasta-ainevasteeseen yksinkertaistettuna tämä tarkoittaa, että infektion tai rokotuksen jälkeen immuunijärjestelmämme ei kehitä yhden tyyppistä vasta-ainetta. Sen sijaan monet solut "oppivat" tuottamaan erilaisia vasta-aineita, jotka sitoutuvat viruksen proteiinien eri fragmentteihin. Joitakin näistä fragmenteista voidaan muuttaa mutaatioiden avulla ja jotkin vasta-aineet tulevat tehottomiksi, mutta tunnistamisen välttämiseksi kokonaan viruksen pitäisi muuttua paljon, mikä voi aiheuttaa sille joitain haittoja. Jotkut virusvariantit osoittautuivat tehokkaammiksi kiertäessään osittain suojaavaa immuunivastetta, mutta niistä ei tullut globaalisti hallitsevia, koska niiltä puuttui myös tarttuvuusetu verrattuna muihin samana ajanjaksona kiertäviin muunnelmiin.
Lisäksi immuunivaste ei rajoitu vasta-aineisiin, ja viruksen olisi kerättävä mutaatioita useille alueille välttääkseen suojamekanismit kokonaan.
Tämä ei tarkoita, että sellaisen muunnelman ilmaantuminen, jota rokotuksen tai infektion jälkeen saatu immuunivaste ei enää tunnista ollenkaan, ilmaantuminen olisi mahdotonta, vaan ainoastaan sitä, että tällainen optimaalinen mutaatioiden yhdistelmä olisi vähemmän todennäköistä lyhyellä aikavälillä.
Onko rokottamisessa mitään järkeä?
Nykyiset rokotteet ovat osoittautuneet tehokkaiksi kaikkia tähän mennessä levinneitä virusvariantteja vastaan, erityisesti COVID-19:n vakavaa kehitystä, sairaalahoitoja ja kuolemantapauksia vastaan.
On epätodennäköistä, että tilanne olisi täysin erilainen Omicron-variantin tapauksessa ja palaamme pandemian aikaan, jolloin rokotteita ei ollut saatavilla.
Myös tällä hetkellä Euroopassa ja suurimmassa osassa maailmaa hallitseva variantti on Delta, jota vastaan tiedämme jo nykyisten rokotteiden suojaavan.
Jos Omicron tai muu muunnos, joka saattaa olla hallitseva tulevaisuudessa, osoittautuu riittävän hyvin kiertävän rokotuksen kautta saatua immuunivastetta, nykyisiä rokotteita voidaan muuttaa nopeasti. Meidän ei tarvitse nähdä tätä poikkeuksellisena. Periaatteessa influenssarokotteet on mukautettu kullekin vuodenajalle hallitsevien viruskantojen mukaan.
Materiaalin on luonut Cătălin Țucureanu, immunologian ja rokotteiden tieteellinen tutkija Kansallisen lääketieteellisen ja sotilaallisen tutkimuksen ja kehittämisen instituutissa "Cantacuzino".
