In iOS 6 Apple heeft het beveiligingssysteem van zijn besturingssysteem aanzienlijk verbeterd, maar daar lijkt het op hij kan worden uitgebuit met behulp van enkele applicaties van App Store die niet goed beschermd zijn. Het SSL-beveiligingssysteem waarmee gebruikers veilig verbinding kunnen maken met verschillende websites wordt besproken, waarbij iOS een lijst heeft met geverifieerde SSL-certificaten die Safari herkent en gebruikers de zekerheid geeft dat ze geen verbinding maken met een website van sommige hackers.
Hoewel Safari gebruikers waarschuwt wanneer ze verbinding maken met een website die een onveilig SSL-certificaat heeft en waarschijnlijk eigendom is van hackers, doen sommige applicaties van derden niet hetzelfde. Sommige toepassingen van derden voor iOS het negeert de lijst met veilige certificaten en accepteert alle soorten certificaten, ongeacht wie ze heeft uitgegeven, waardoor gebruikers worden blootgesteld aan hackers die heel gemakkelijk hun gegevens kunnen stelen als ze toegang krijgen tot de server waarmee ze toegang krijgen tot internet.
Voorlopig is er slechts een korte lijst met Amerikaanse applicaties gepresenteerd, maar aangezien er ruim 750.000 applicaties in de App Store staan, bestaat de mogelijkheid dat veel daarvan onveilig zijn.
